美吉生物

基因表達調控 轉錄組 全轉錄組測序

全轉錄組測序 技術參數 留言咨詢

隨著RNA,特別是非編碼RNA研究的不斷深入,單一的轉錄組學測序已經不能滿足現有的科研需求,為系統的揭示生物現象背后RNA世界的轉錄調控規律,全轉錄組應運而生。全轉錄組的研究不再局限于mRNA,同時涵蓋了種類豐富,數量龐大的調控型非編碼RNA分子(包括miRNAlncRNAcircRNA等)。全轉錄組高通量測序,采用去核糖體鏈特異性建庫方法和小片段富集篩選建庫方法,可實現編碼RNA和非編碼RNA的建庫、測序、生物信息學分析及聯合分析、ceRNA調控網絡等,從而快速全面準確地獲得與特定生物學過程(例如生長發育、疾病發生等)的數據信息,全轉錄組學研究將調控機制研究延伸到網、多層面結合的立體模式,有助于相對全面解讀生物學現象。


適用范圍

? 1)生理調控:動植物生長發育、新陳代謝研究

? 2)外源脅迫:營養缺乏、抗逆、抗病蟲害調控機理研究

? 3)表型性狀:動植物表型(肉質、花色)形成等研究

? 4)藥物效應:動物或人體疾病用藥效果

? 5)致病機理:疾病發生發展過程機制

? 6)分子標記:疾病潛在潛在biomarker篩選,作為預后、治療指導


美吉優勢

? 1)突破單一RNA類型限制,實現轉錄+調控的全方位研究

? 2)數據豐富,一次實驗,同時獲得4RNA信息

? 3)ncRNA靶基因預測,功能注釋,多維度的關聯分析

? 4)緊扣前沿科研熱點,構建ceRNA網絡

? 5)經驗豐富,實驗流程成熟,數據可靠

? 6)采用云平臺交付數據,多維度結果圖片展示,數據圖表循環挖掘


實驗流程



生信分析





技術參數


樣本要求

動物:≥1?g

植物:≥2?g

全血:≥?2?mL

細胞:?5×106?cells

RNA要求

≥4?μg200?ng/μL

建庫測序

longRNA-seq去核糖體,鏈特異性文庫,Illumina?PE150測序

smallRNA-seqSMART技術建庫,Illumina?SE75測序

數據量

mRNA+lncRNA+circRNA15G?clean?data

miRNA10M?raw?reads



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